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Les monomères d'hydrogel sont diffusés uniformément dans l'échantillon fixé via le kit de solution d'hydrogel X-CLARITY™, puis placés dans le système de polymérisation X-CLARITY™. En liant les biomolécules à un réseau d'hydrogel stable dans un environnement anaérobie, les monomères se polymérisent, protégeant ainsi les informations moléculaires et l'intégrité structurelle. Le système de transparisation X-CLARITY™ II utilise une solution de transparisation électrophorétique pour nettoyer l'hybride tissu-hydrogel. Il reste un hybride tissu-hydrogel qui est chimiquement accessible pour le phénotypage moléculaire après l'extraction active ou passive des lipides par électrophorèse.
En utilisant le kit de coloration d'anticorps DeepLabel™, les échantillons transparisés sont marqués avec des anticorps qui pénètrent plus facilement. Optimisé pour les échantillons de tissus transparisés, DeepLabel™ peut être utilisé avec des tissus transparisés par différentes méthodes de clarification telles que CLARITY passif ou actif, iDISCO, 3DISCO, uDISCO, Visikol ou CUBIC.
Avant l'imagerie, l'hybride tissu-hydrogel est trempé dans une solution qui correspond à l'indice de réfraction (IR) de la solution. Cela permet d'homogénéiser la solution et l'environnement du tissu. La transparence optique et la qualité de l'image sont ainsi améliorées grâce à une réduction de la diffusion de la lumière.
“[The X-CLARITY] has actually been fundamental to the Data Brain Project because without being able to clear tissues of the lipids, we wouldn’t be able to image deep into brains. So we wouldn’t be able to extract that structural information that is so important to understand the function of mammalian brains. It’s been a huge advantage and a great leap forward in imaging.”
“Thanks to X-CLARITY, we now have access to the threedimensions of the whole heart organ.”
