Esta tinción es un colorante permeable a las células que se une a los ácidos nucleicos. La naranja de acridina emite fluorescencia verde cuando se une al dsDNA, mientras que emite fluorescencia roja cuando se une al ssDNA o al RNA.

La tinción de naranja de acridina puede utilizarse con la tinción de yoduro de propidio (F23003) para evaluar la viabilidad de las células con los contadores celulares de fluorescencia automatizados de la familia LUNA™. Las células nucleadas que son viables mostrarán una fluorescencia verde, mientras que las que no son viables mostrarán una fluorescencia roja. Debido a la transferencia de energía de resonancia de Förster (FRET), la señal de yoduro de propidio absorbe la señal de naranja de acridina en las células no viables, lo que garantiza que no se produzcan resultados doblemente positivos.